治疗食管炎分中医和西医两种方法，总体原则均为减少对食道刺激，减少胃内容物的反流。中医治则是和胃降逆，防止胃气上逆。西医采用抑制胃酸和促进胃向下排空的药物，以防止胃内容物向上反流到食道。同时，可采用中医中药和针灸的方法治疗反流性食管炎。通过中医辨证选择性的配备汤剂，或通过针灸的方法，防止食道受胃液刺激，以达到治愈的目的。
