做胃镜时可能在取材时将胃黏膜夹伤，出现人为的溃疡，属于胃镜后疼痛的主要原因。此时患者可以服用奥美拉唑减少胃酸分泌，达到止痛的目的，也可使用铋剂或硫糖铝使胃黏膜表面形成保护层，使创面不和消化液接触，从而减轻疼痛。
部分胃镜可能会造成黏膜撕裂，而这种疼痛较为顽固，患者至少需要服用一周奥美拉唑进行控制。另外，患者还需要进行饮食调节，避免进食生冷、较硬的食物，因为胃处于炎症或溃疡的状态下，进食此类食物可能会加剧疼痛不适。
