病毒性心肌炎发病原因尚不明确，目前对于患病机制研究较多，但无最终结论，发病机制既不类似于细菌合成细菌毒素造成病变，也非关节炎、肾炎免疫复合物，主要原因与机体免疫应答相关。由于病毒感染后，自身发生抗原抗体反应，导致病毒对全身系统造成损伤，尤其是心肌损伤，目前尚无特效治疗药物，主要采用对症治疗，如改善抵抗力、应用激素减少心肌损害等。
