疾病有后遗症，手术治疗操作有并发症，房颤射频消融后遗症可以简单分成心房颤动后遗症和射频消融并发症。心房颤动后遗症主要是心脏扩大和心力衰竭，另外由于血栓引起组织脏器栓塞缺血，比如中风可能与心房颤动有关。
射频消融的急性期并发症或者慢性期并发症可能出现心包积液、心包填塞、房室传导阻滞，即心脏电路传导阻滞。患者在做手术过程中，比如做大腿根股静脉穿刺，颈内静脉或者锁骨下静脉穿刺等，可能出现出血和血栓栓塞，射频消融远期并发症可能有肺静脉狭窄。
