克罗恩病是一种自身免疫性疾病，牛奶中的异性蛋白作为抗原可引起患者自身免疫状态发生改变。牛奶中含有乳糖，缺乏乳糖酶的人饮食牛奶后可引起腹泻，而克罗恩病本身会导致腹泻，喝牛奶可能使其症状加重。牛奶易变质，误食变质牛奶会引起肠炎，导致腹泻再加重。患者要根据饮食牛奶是否会引起腹泻加重来决定是否可以喝牛奶，而非绝对不允许。
