判断脑内有无寄生虫，首先需进行影像学检查，除CT检查以外，还需进行头部磁共振检查以发现颅内相应病变。有时还需做腰椎穿刺辅助诊断，检查脑脊液来判断有无寄生虫感染，比如脑脊液嗜酸性粒细胞是否增高。对于仅有脑实质病变而无相应脑脊液改变的患者，有时需借助神经外科手术或神经外科的立体定向穿刺活检，以确定患者是否存在颅内寄生虫感染。
如果寄生虫感染为局限性的病灶或者在颅内较表浅的部位，一般需依靠神经外科医生手术将病灶切除，并做病理检查进行确诊。
