扁桃体切除术的麻醉方式包括局部麻醉和气管插管全身麻醉，随着医疗技术水平的提高，目前临床主要采取全身麻醉行扁桃体切除术。全身麻醉比局部麻醉更有优势，局部麻醉下扁桃体切除，术中患者痛苦较大，尤其是小儿，可使其产生恐惧心里，甚至影响终身；全身麻醉下扁桃体切除，术中患者意识消失，无法感知到痛苦，可避免产生恐惧感。
