如果怀疑或者有相关的症状需要确诊结肠炎，首先要选择结肠镜，通过对整个大肠的全结肠的结肠镜检查，去发现和判断是否存在结肠炎。判断属于哪类的结肠炎，结肠的病变位置在哪，将问题明确后方便下一步的治疗。很多结肠炎属于慢性非特异性的结肠炎，镜下表现即某段肠的黏膜充血水肿、血管网模糊，临床症状上即有时有些腹痛、大便次数多、大便不成形等。还有肠炎较严重就是溃疡性结肠炎，更严重的是克罗恩病，首先要明确病变的部位及严重程度，必要时还会取组织活检，为进一步治疗做准备。
