肛瘘的病因目前尚无法明确，只能够了解肛瘘的发展规律。目前公认肛瘘的发病原因是肛腺感染引起脓肿、皮肤穿透或者医治时切开引流后穿透皮肤。肛瘘的整个发病原因与饮食、生活习惯有一定的关系，即饮食和生活习惯是促进发病风险的原因，但是并不是根本原因。注意饮食、注意生活习惯并不能预防肛瘘的发生，但是可以减少肛瘘发生以后的症状发作。
肛瘘的症状即肛门周围皮肤反复肿痛、破溃、流脓，因为与肛门内感染的肛腺相通，最后形成固定的窦道，必须进行手术切除才可将其治疗。
