卵巢功能不全不仅会引起月经量少，而且会引起卵巢囊肿。青春期女孩卵巢发育不全、围绝经期妇女卵巢功能逐渐衰退，不仅引起月经量少，而且会引起生理性囊肿，需要药物治疗。
卵巢本身出现问题，如多囊卵巢综合征，卵巢会分泌雄性激素，影响雌激素分泌或者对抗雌激素，这时患者不仅月经量少，而且会出现不孕不育或者毛发生长等。还有一些卵巢肿瘤，如颗粒细胞瘤、卵泡膜细胞瘤或者性索间质肿瘤，也会分泌雌孕激素或者雄性激素，引起月经异常。
