脑脓肿多根据不同类型、病程的不同阶段而采取不同的治疗手段。目前通过外科手段、药物治疗、增强免疫等综合治疗手段，脑脓肿的治愈率明显提升。脑脓肿术后为防止复发，需增强体质，避免感染发生，如肺炎、心内膜炎、耳源性感染、鼻窦性等。术后0.5-1年需随访复查，如果术后1-2年复查无复发症状，则无需每年复查。若采用穿刺引流术，脓肿包膜等会有残留，随疾病进展，会逐渐形成炎性肉芽肿，需定期复查，观察肉芽肿的形态有无变化，若无变化，则无需定期复查。
