跖疣主要是足跖部，即脚底板长的疣，治疗较困难。其它部位疣体都是向外生长的，跖疣因为患者经常行走、挤压，一般往内生长。如果用冷冻、激光破坏性治疗，很难将其彻底清除。在临床上主要是通过中药内服外洗，再结合破坏性治疗。假如通过内服外洗就可以完全消除当然更好，部分情况无法达到完全消除，仅可缩小疣体，可通过冷冻、激光等破坏性的方法彻底治疗，也可以用光动力疗法。
