鼻内窥镜手术并发症包括出血、眼部并发症、颅内并发症、术腔粘连和鼻窦口闭锁等。由于鼻窦比邻眼眶、前颅窝、筛前筛后动脉和颈内动脉，一旦存在解剖变异或者手术医师解剖结构不熟悉，则容易造成损伤。眼部并发症包括眼眶内血肿、鼻泪管损伤、眼内肌损伤、视神经损伤等，颅内并发症包括脑脊液鼻漏、颅内血肿、颅内感染、脑实质损伤等。术腔粘连和窦口闭锁是因为围手术期治疗和护理不到位所致，而严重鼻窦炎、鼻息肉由于术中黏膜损伤严重、窦口开放不彻底所致。所以为了有效避免术中术后并发症出现，需要医患双方密切配合共同努力，鼻内镜手术医师需要进行规范化培训，主要包括解剖培训、手术操作技术培训和治疗理念培训，而对患者要求是要严格遵守术前、术后随访和持续性治疗要求，保证术腔黏膜顺利上皮化。
