乳腺导管内乳头状瘤的主要与以下疾病进行鉴别诊断:1、以乳头溢液为主要首发症状的导管扩张症;2、乳腺炎症性疾病;3、肿瘤性病变,如以主要乳头溢液首发症状的乳腺导管癌。这需要通过以下方面进行鉴别:1、通过溢液的细胞学检查,阳性率比较低;2、通过乳腺超声检查,能够发现乳腺导管内低回声的物体,如米粒大小的肿瘤;超声除导管扩张以外,还有低回声的小肿瘤,来鉴别这种炎症与导管瘤;3、导管镜检查为比较直接的检查方式,可以直接看到肿瘤,与炎症来进行鉴别;4、钼靶检查也可以鉴别导管瘤与乳腺癌。乳腺导管打完造影剂以后,可以明显的看到乳腺导管内有个隆起,可以明确导管内乳头状瘤的诊断,另外通过拍钼靶也可以排除有钙化或者有肿块的导管癌;5、乳腺的磁共振检查,对于乳腺很小的导管内乳头状瘤鉴别意义不是太大。如果出现导管内乳头状瘤的恶变,乳腺磁共振检查会有一定价值。