巧克力囊肿复发率较高,复发后要根据症状、年纪、生育要求选择不同的治疗方法 。如果复发囊肿较小、没有其他症状,且无生育要求,可以使用孕激素药物维持低水平激素,使子宫内膜不随月经周期波动,从而达到治疗目的。服用药物需要2-5年,部分患者复发囊肿较小,服药后可以完全消退。如有生育要求,需要到生殖科医生处就诊,评估目前的卵巢功能,查看是否需要助孕以及用何方法。对于有生育要求的患者,生育是最大的问题。巧克力囊肿与卵巢连接较密,剥除卵巢囊肿时,可能会损伤卵巢组织,反复手术对卵巢损伤较大,所以要尽量避免二次巧克力囊肿手术。巧克力囊肿术后,通常需要辅助药物治疗,常见的药物是GnRH-a(促性腺激素释放激素激动剂)类药物,可以抑制性腺轴,使巧克力囊肿复发减少。但是GnRH-a类药物只能服用3-6个月,否则会产生其他副作用。服用GnRHa类药物后,可以加服用其他药物如短效避孕药,使激素水平波动不明显,从而减少巧克力囊肿复发。也可以使用孕激素药,预防效果较好,可服用时间较长。