小儿肛门狭窄的治疗，主要通过外科手术，即肛门成形术治疗。患儿只要做简单的后期成形即可。手术后护理较重要，包括手术后扩肛。患儿手术切开、缝合后创伤较大，部分家长不重视肛门狭窄扩肛，导致患儿术后疤痕再次形成狭窄，甚至比术前狭窄更为明显。
因此手术结束后，需进行正规扩肛；如未进行扩肛处理，后续肛门狭窄环、疤痕环形成后处理，可引起患儿肛门功能不良，表现为排便功能异常、射精异常。
