蝶腭神经痛在临床治疗方法对于轻症患者可以口服药物，目前也有喷剂，可以在发作前或者有预感之前经鼻喷剂，这叫佐米曲普坦喷剂。
而口服药物可以口服佐米曲普坦，这种丛集性头痛是发作性的疾病，一年在季节变化时高发，所以对于轻症患者，通过鼻喷剂或者是口服药物缓解的情况下，可以进行药物治疗。
如果疼痛比较严重，可以行蝶腭神经节的阻滞治疗，这种阻滞治疗有的患者缓解情况也比较好。对于严重的蝶腭神经疼痛患者，可以考虑蝶腭神经节射频治疗。
